乳がん以外でも値が高くなるマーカーや乳がんがあっても値が高くならない人もあり、幾つかのマーカーの変動を検査しながら、治療効果や術後の状態をフォローするのに使われています。　

乳がんでは、CEAやCA15-3、NCC-ST-439と呼ばれるマーカーか主に使われています。 　

乳頭の分泌液に含まれる腫瘍マーカーについてはCEAを測定する方法が広く行われています。 しかし、通常の初回手術時にこれらのマーカーが上昇することは少ないです。